1956年成立四川省马尔康中学第一支师生混合足球队，多次获得阿坝州"雪山杯"足球比赛冠军荣誉称号。直到2003年由初中学生组成男女两支足球队（乙组）。2005年由州体育局与教育局统筹安排，我校女子足球队迁往九寨沟中学。2006年参加达州省运会男子足球队取得第五名的好成绩。2014年8月响应习总书记的“中国梦”的号召，在学校的高度重视下我校成立了校园男子高中组、初中组、小学组三支足球队。学校聘任专职足球教练员一名，足球教师4名担任校园足球队的专职教练，通过长期坚持训练，校园足球队的竞技水平不断提高。每周每班初中开设一节足球课，高中开设一节足球走班课，每学年举行一次班级足球联赛和校级联赛。自2015年来每年代表阿坝州学校参加四川省青少年校园足球联赛总学赛暨四川省中学生足球比赛。2018年参加阿坝州"雪山杯"，取得亚军的好成绩。我校学生岳海东获19届雪山杯最佳射手荣誉称号。学校每年举办了校园足球文化节，开展了班级足球联谊赛和有关足球的绘画、作文竞赛、演讲比赛等系列活动，掀起了全校师生热爱足球运动的热潮，彰显了我校"体育见长"的办学特色。